Η Χημεία μελετά τις ουσίες, ανεξάρτητα από το μέγεθος και το σχήμα τους. Βελόνι από σίδηρο, μαχαίρι από σίδηρο και σφαίρα από σίδηρο έχουν προφανώς διαφορετικό μέγεθος και διαφορετικό σχήμα. Αν όμως λησμονηθούν οι δύο αυτές ιδιότητες, απομένει σύνολο άλλων ιδιοτήτων κοινών και στα τρία ανωτέρω σώματα: οι ιδιότητες της ουσίας σίδηρος. Τις μακροσκοπικές ιδιότητες των ουσιών η Χημεία προσπαθεί να συσχετίσει με τις λεπτομερείς ιδιότητες και τη συμπεριφορά των μορίων, από τα οποία αποτελούνται οι ουσίες. Από τη συσχέτιση αυτή επιτυγχάνεται πρώτα ερμηνεία, συστηματοποίηση, γενίκευση και ενοποίηση πολλών φαινομένων της Χημείας. Περαιτέρω, οι μακροσκοπικές ιδιότητες οδηγούν στην ανακάλυψη νέων και λεπτομερέστερων ιδιοτήτων των μορίων. Οι τελευταίες χρησιμοποιούνται με τη σειρά τους για την πρόβλεψη άλλων μακροσκοπικών ιδιοτήτων, άγνωστων μέχρι τώρα και των οποίων την ύπαρξη ουδέποτε θα είχαμε υποπτευθεί. Από τις ιδιότητες των ουσιών, τη Χημεία ενδιαφέρουν κυρίως οι χημικές αντιδράσεις, δηλ. οι μετατροπές των ουσιών σε άλλες ουσίες, με τελείως διαφορετικές ιδιότητες από τις αρχικές. Οι χημικές αντιδράσεις των στοιχείων και των ενώσεών τους μελετώνται στην Ανόργανη Χημεία, εκτός από τις αντιδράσεις των ενώσεων του άνθρακα, τις οποίες μελετά η Οργανική Χημεία. Οι γενικές αρχές όμως και οι νόμοι των χημικών αντιδράσεων είναι αντικείμενο μελέτης της Φυσικοχημείας.