Η έκδοση Θεσσαλονίκη. Από τα προϊστορικά μέχρι τα χριστιανικά χρόνια είναι αφιερωμένη στα 2300 χρόνια της Θεσσαλονίκης και πραγματοποιήθηκε με τη συμβολή και το ενδιαφέρον της Οργανωτικής Επιτροπής του εορτασμού και του Υπουργείου Πολιτισμού. Στον οδηγό της έκθεσης τα εισαγωγικά κείμενα κάθε ενότητας ετοιμάζουν τον επισκέπτη για τη θέαση και τη μελέτη των εκθεμάτων που παρουσιάζονται συνοπτικά στο τέλος αυτής της έκδοσης.